引子：
我——小林芳雄，是名侦探明智小五郎的得力助手，同时也是少年侦探团的团长。在少年侦探团中除了我，就剩下真由美和壮二了。最近老师明智小五郎出国了，侦探事务所里就由我来主持大局。
又是一个宁静的早晨，我按照常规留守在事务所中，这时真由美过来让我帮她寻找丢失的少年侦探团徽章。通过调查，我得出的结论是她把徽章掉在书架上，果不其然真由美在那里找到了她的徽章。
刚刚找到了真由美的徽章，壮二就神情慌乱地跑进来……原来壮二的家，也就是豪门羽柴家收到了怪盗二十面相的盗窃预告书，他妄图盗取羽柴家珍藏的俄国沙皇皇冠上的六颗钻石。自己的小弟有难，做老大的岂能坐视。得知了预告书的内容后，我与真由美结伴去了壮二的家 。
第一话
一进羽柴家我就感觉到上上下下的紧张心情。门窗锁得严严实实，每个房间都安排好人守护，甚至还请来了几位休假中的POLICE，人人都严阵以待防备二十面相。在会客厅，我见到了壮二的父亲壮太郎，我三言两语就让壮太郎扫除因为年龄小而带给我的偏见。一方面因为我的到来，另一方面由于长子壮一在离家10年后也要在今天回归，壮太郎紧张情绪得到舒缓，让我放手去展开调查。
壮一为什么选在这个时间回归，我的心中忽然感到有一丝不安。也许是多虑吧，我继续手上的工作，依次检查了厨房、花坛、水池，最后来到书房检查存放钻石的保险柜。高墙、紧锁的门窗、隐藏的陷阱和最新型的保险箱……
看来羽柴家安全保卫工作十分到位，我马上回到接待室向壮太郎汇报。
这时，长子壮一也终于进入了家中。一家团圆，我和真由美也被邀请参加家宴。一边享受着丰盛的晚宴，我一边旁敲侧击地询问壮一的事情，可是壮一的回答都滴水不漏。当当的敲门声响起来，司机松野送来了一张电报，上面写着“今晚12点准时来取钻石”。该来的终归要来，整个羽柴家立刻就忙碌起来。女仆守在餐厅，壮二和松野守在接待室，壮太郎和壮一守在书房。我反复地巡查，玩家们也忙忙碌碌，时间很快就到了预告书说的12点，似乎二十面相放弃了这次的盗窃行动。
突然，楼上传来了“啊”的一声叫喊，我和真由美迅速赶到书房，其他人也很快就赶到了。书房中的壮太郎和壮一满脸不可思议地看着桌子上的空盒子，钻石竟然在两个人眼皮下不翼而飞了!我第一时间询问了壮太郎，这里面有古怪——书房从来没有别人进入过。在11点50分的时候，钻石还好好的呆在保险柜中。仅仅是在几分钟前为了确认钻石，壮太郎才从保险柜中取出来后，短短几秒钟内就在眼前消失了。详细再问了一下，我发现壮太郎和壮一并没有一直紧盯着钻石，他们俩的注意力曾被一个白色的东西吸引，就在这短暂的走神时间，钻石被盗了。在桌子下，我发现了那个白色的东西——一只乒乓球。
壮一推说这个乒乓球是壮二遗留在书房里的，壮二却一点也记不起来了，这让我对壮一再一次起了疑心。通过对书房的观察和周围人提供的信息，我断定钻石一定还在屋里的某个人身上，而这个人就是二十面相变装的。谁是二十面相?答案很明显就是壮一。
暴露了的壮一回复本来的面目，从书房的窗户跳了出去。
关于第一个拼图：
第二话
二十面相想要从层层设防的羽柴家逃脱几乎是不可能的，玩家们坚信着这一点追了出去。在花坛那里我们发现二十面相中了壮二设好的陷阱受了伤，真是天大的好消息。
来到水池，看到有一段竹子露出水面，但因为天黑真由美阻止了我进一步的调查。在房子周围找遍了花坛、水池，那里的人也都说没有见到二十面相。不甘心的我们回到书房，我忽然想起一个在意的地方，真由美、壮二急匆匆地跟着我又一次来到水池。我们发现水面上露出的竹段不见了，水池边上也有2截竹子，草地上也被人踩踏过。顺着草地上脚印我们来到一棵树下，树身上沾着潮湿的泥巴，抬头看上面竟然有人——竟然是司机松野先生。他被二十面相击昏，衣服也被抢走 。我们赶紧叫人把他救起。
第二天，松野醒过来。他对我讲述了昨晚与二十面相遭遇的情形。在旁边倾听的真由美忽然喊到“在这个屋子里的是变装成松野先生的二十面相吗?”这个我早就料到了，现在需要做的是一个房间一个房间去寻找变装了的二十面相。可惜棋差一招，怪盗二十面相已经利用变装带着壮二逃跑了。
由于壮二被诱拐，羽柴壮太郎失去了对我的信任，报了警。POLICE到来不久，一个叫木下的男人把二十面相偷走的车开了回来，在车上发现了一个信封——二十面相要求壮太郎拿祖传的观音像交换壮二。
得知消息，壮太郎恳求我帮助他救出壮二，我也很乐意地接受了他的请求。周密地准备是我一向的原则，我提出去看看观音像以获取有价值的情报，当我看到观音像的实物时浮想出一个大胆的计划……
天黑了，二十面相带着手下人搬走了观音像，稍后一个谜之人出现告知壮二已经回到羽柴家。
当观音像刚被搬入藏宝屋，二十面相就打发走了手下人。此时观音像竟然拿出手枪，瞄准他。怪盗在枪口下无奈决定归还昨天偷走的六颗钻石。
同时，他也猜到了伪装成观音像的人就是我，并趁我不注意拉动了机关。当我恢复意识时，发现自己身处二十面相藏宝屋的地下。天太黑了，我决定等天亮再寻找逃脱的办法。
第二天一大早醒过来，我就开始行动。首先利用绳子爬到窗口附近观察周围环境，然后把消息写下来让信鸽小比波送回到羽柴家。我刚做完这些事情，二十面相就推门而入，差点被他发现真是好险。二十面相在我面前耀武扬威，却不知道危机将近。过了一会儿，POLICE赶到并包围了怪盗的老窝。面对着POLICE，二十面相根本顾不上我仓皇逃跑，但是，很快就被POLICE抓住。我被POLICE解救后回到了侦探事务所，真由美和壮二对我一个劲地拍马屁。就在我们沉浸在美丽幻想的时刻，刑警中村找上门来告诉我们抓到的是个冒牌货二 十面相，真正的怪盗仍然逍遥法外。
关于第二个拼图：
第三话
在与二十面相第一次交锋后过了几天，我们听说师傅近期要返回日本。为了避开热情的记者，师傅返程的确切时间只有极少数人知道，小侦探团的成员只能满心期待地守候着。虽然师傅能力超群，但我们心中还是有一丝不安，还有就是一点不能去机场接师傅的遗憾。
终于，一天中午师傅乘坐着一辆警车回到了侦探事务所。刚进门师傅立马夸奖我们三个，为我们击败了二十面相感到骄傲。接着师傅告诉我们他之所以这么晚才回到事务所的原因，不过我们需要在师傅讲述的时候回答问题，借此师傅要考查我们三个的推理能力……
片段(一)
大侦探明智小五郎从飞机场走出，早已等候多时的前川刑警马上迎了过去，帮明智搬行李。明智和前川寒暄之时，从远处过来一个满头白发身材也已发福的老人。明智询问他是否辻野先生，他承认是来自外务省的辻野。明智收出右手，看到后辻野略一迟疑也伸出了戴着手套的右手和明智握手。辻野告诉明智有重要的事情需要他的协助，并把明智带到了铁路饭店。小五郎根据一路上遇到的疑点，确定眼前这个人就是二十面相变装而成的。进入了预订房间，小五郎又问了辻野4个问题，更进一步确定了自己的想法，一语道破二十面相的伪装。
我从这段话里听出了四个疑点：
1、辻野知道明智回国的确切时间。
2、戴着手套握手是不礼貌的，作为外务省的工作人员辻野应该很清楚。
3、明智一进铁道饭店预订好房间的门服务员就喊出了明智小五郎的名字。
4、辻野对二十面相的事情知道的过多，而一般人是不知道的。
片段(二)
露出正体的二十面相和明智小五郎针锋相对，二十面相试图把师傅监禁起来。面对着二十面相和他手下的威胁，小五郎并不慌乱，原来他已经事先与前川定好暗号一旦出现意外POLICE就会到来。沾不到便宜的二十面相无奈之下只得同意不再出手，而小五郎也同意不发出暗号。
前川刑警在饭店楼下看到了二十面相的身影，已经报了警。
二十面相匆匆离开饭店之际，POLICE也赶到了。对于中村刑警的问题，小五郎毫不避讳告诉中村他放走二十面相是为了一网打尽怪盗那一伙并找回丢失的物品。可是固执的中村坚持立即抓捕二十面相，还把小五郎带回了POLICE局作笔录。
很快前川带回了一个嫌疑人，经过一番调查被抓的这个“辻野”只不过是一个被怪盗利用而已。二十面相又一次逃过POLICE的追捕。
这次师傅问我“二十面相是怎样逃脱的”。我思考了一下，把我的推理告诉了师傅。“正解”，师傅满意地拍了拍我的肩膀后又对我说了一些莫名其妙的话。
关于第三个拼图：
第四话
铁道饭店的风波过去了几天，一切都很正常。可是时时在街角监视着事务所的小贩，他的出现提醒着我们二十面相很快就有大的阴谋了……
一天早上，一个叫做赤井的男人找上门来找师傅报仇，不过却被师傅一个帅气的过肩摔秒杀。在少年侦探团的注视下，赤井逃跑了，而一直监视着事务所的小贩也跑去找赤井。这可不太妙，赤井要与二十面相的人联合起来。我想到这里要立刻告诉师傅，可师傅不待我说完就去休息室了。事情是一件接一件，没过几分钟一辆豪华轿车停到事务所的门口，一位美艳的女子下了车后急着要求见师傅。过了一会，师傅决定跟她一起出门。我们很担心，但师傅拒绝了我们随行的要求。车子开到青山墓地突然停下了，周围出现了赤井和二十面相的手下人。原来美女和他们是一伙的，师傅中了他们的圈套。敌人人多还带着枪，面对这种情形师傅只得放弃抵抗。
第二天。师傅已经七个小时没有和我们联系了。对于小五郎已经被抓仍不知情，小侦探团的各位坐立不安，玩家们打算靠自己的能力调查去协助小五郎。通过真由美和柚木的回忆，我们整理出一些线索，柚木还画出了昨天出现的美女肖像画。掌握了这些材料，事不宜迟我决定立刻赶去青山墓地调查。来到青山墓地看到一片荒芜，我第一反应就是美女留下的是假地址，师傅情况不妙。但是心中仍抱有侥幸心理的我期待回到事务所能得到好消息。刚进事务所的门，真由美就慌慌张张地告诉大事不好——二十面相明天要去盗窃国立博物馆，师傅也被二十面相抓走了。这种危急的情形下，越是紧张害怕越是糟糕，我安慰着真由美稳定她的情绪。最后，我让真由美和壮二两个人再去青山墓地调查，而我则去国立博物馆去应对二十面相的挑战。约好晚上7点会合后，我们三人兵分两路出发了。
出发后，真由美和壮二首先找到前川刑警，可是因为其他二十面相的原因没有多余的人去帮助寻找明智老师。前川告诉我们他看到过师傅乘坐的轿车并答应把美女的肖像复印下去搜查她的下落。从前川那里出来，两人直接跑去了青山墓地，这里他们遇到了一位巡警，也获得了他们急需的情报——不远处有一座房子。两人来到房子那里刚巧偷听到二十面相手下的对话，真由美看到房子周围没有守卫提出要潜入到房子里，壮二劝说无效只得跟着她一起进入这所房子。这又是一个圈套……
就在真由美和壮二去青山墓地调查的同一时间，我来到了国立博物馆参加针对二十面相的警备会议。会见完北小路馆长，我照例走遍了博物馆去调查周围的环境。
首先来到外门，这里大门紧锁，门口已经布置好了警卫，一切都已就绪。接着我又来到里门，这里摆放了很多木头，人来人往很繁忙的样子。找到里门的POLICE和博物馆工作人员斋藤了解到从5天前开始整修旧的宿舍，所以后门这里有一个工地。这里虽乱，但POLICE说一切尽在掌握。最后我来到展厅，这里是由中村刑警负责，他经验老道展厅的防范工作可谓毫无漏洞。以防万一，我又找来专家鉴定展厅里的文物，还好文物没有被二十面相调包，全部都是真品。差不多到7点了，我向北小路馆长汇报完就赶回了事务所去与真由美和壮二会合。
回到了事务所后，我苦苦等了一夜仍不见真由美和壮二回来，心里盘算他们可能遇到了麻烦。
不过面前最重要的还是国立博物馆的安全，暂时放下对真由美二人的担心，我赶去了国立博物馆。惯例我是要巡视一遍的，当我巡视到里门，似乎感到眼前的情形有些不自然——货车不见了。
当下，我找来POLICE进行询问，可是这么POLICE非常傲慢根本没把货车当回事。对于这件事，我只能叹口气继续巡查。最后要检查的地方是展厅，负责安全的中村告诉我昨晚负责守卫展厅的是博物馆的工作人员，没办法我又跑去询问北小路馆长。就在这时师傅，大侦探明智小五郎，奇迹般的出现了。真由美和壮二也一起出现在眼前。
随着师傅的出现，时间也到了二十面相预告的12点。什么事情都没有发生，玩家们都安心了，可是师傅却说二十面相已经把博物馆偷空了!闻听这个，中村带着玩家们火速赶到展厅，在那里每件艺术品都完好安放在原来的位置。师傅这时来到一座雕像前，天啊，他竟然把瓣下了雕像的手臂——这可是国宝!仔细一看，这个雕像竟然是赝品，整个展厅里的现在都是赝品!博物馆真的被二十面相搬空了!
一件件惊人的真相被老师小五郎接二连三说了出来，更令人震惊的是现在我们身边的北小路也是假的，他是二十面相的变装。
原来为了看到当得知文物被调包时玩家们的震惊的面容，二十面相并没有逃走。聪明一世糊涂一时，这次他可是无处可逃了。二十面相不是一个这么容易抓到的人，一颗突如其来的烟雾弹炸开，他趁乱跑出了展厅。玩家们在后面紧追 不舍，他马上就逃掉了，我掏出了小比波祈祷能有用。猝不及防之下，二十面相竟然被小比波吓倒了，玩家们这次终于抓到了怪盗二十面相。
关于第四个拼图：
尾声
又是一个上午，中村破门而入大喊“二十面相逃跑了”，除了师傅以为屋内的人全都大吃一惊。奇怪的是中村刚离开，又一个中村再一次闯进来大喊“不好了，二十 面相逃跑了”。原来第二个进来的才是真正的中村刑警，那第一中村自然就是……
二十面相与明智小五郎的故事没有结束，激烈的对抗仍要继续下去……
